但传统的人←工种植存在诸如病虫害发生严重导致的农药泛用而药材农残严重、不同区域不同药农种植的药用植物外形特征各异、产量和质量稳定性差等诸多缺陷。
植物工厂成为了药用植物发展的新出路，超洁净的种植空间解决了病虫害对药用植物的影响，不需施用任何农药，保证了药材的安全性。1. 中药材市场准入门槛过低，且主要靠农户分散种植，种植技术粗放，效率低下。2. 中药材种植有地域性，在道地产区以外种植，因缺少了独特生长环境，导致药材外形特征各异，品质受影响。3. 病虫害发生严重导致中药材种植存在滥用农药化肥现象，加之部分种植地区的环境污染问题，造成药材农残、药残、重金属超标等问题。由此造成的原材料品质不确定性严重影响着中药材的药效和价值，最终可能影响到大众对中医疗效的信任度，以至于影响中医药持续健康发展。
植物工厂种植的霍山石斛
植物工厂种植的有机金线莲
为什么要在植物工厂里种药材其中草药类的药材种植周期较短，高价值的品种多，加上依托植物工厂成熟的蔬菜种植技术，容易实现大规模生产。
而根茎类药材因为市场需求量大，也会是未来植物工厂药材种植的品类之一。但根茎类药一般种植周期长，水肥管理技术要求高，病害防治困难，这些因素造成了植物工厂根茎类药材种植成本高。
所以根据现有的植物工厂种植技术，根茎类药材种植时可优先★选择一年生的根茎类药材，或者进行多年生根茎类药材育苗，如植物工厂一年生人参苗根长比林下一年生人参苗根〖长提高50%。
无论是草本类、根茎类还是食用菌类药材，进行植物工厂种植都要满足以下几个关键因素：1、种植周期短：种植周期短就意味着一年可以进行多次采收，如果植物工厂药材种植4个月的产量和质量能达到林下1-2年的种植水平，那么植物工厂药材种植就有很大的时间优势，产品上市快有利于控制成本回笼资金。2、需光低：植物工厂的维护成本有40-50%是电费，低光需植物意味着低光强也能正常生长，这会很大程度节约电费成本。3、株高矮，冠幅小：植物高度决定了种植模组固定层高内的层数，层数越多意味着种植面积越大，药材总产量就越高。4、市场ω价值高：市场价值高的药材才会有高收入，所以高附加值的药材会是未来植物工厂药材种植的首选品种。植物工厂种植优ω 势：1.周年连续高效生产：植物工厂作物种植不受环境气候条件制约，可实现周年连续高效生产，保证中药材供应的稳定性。
2.打破中药材种植地域性限制：植物工厂能通过设施内高精度环境控制，可对基质、水、肥、光、温进行调控，模拟中药材道地产区的种植环境，定向促进药材有效成分的形成和积累，打破中药材种植的地域性限制。
3.无需使用农药：植物工厂封闭式的种植环境，能有效控制病虫害的发生概率，从根源杜绝农药的使用，重金属污染也不可能出现在植物工厂的产品里，使得中药材原料的安全性有了保障。
金线莲基质种植培养期
一方面，科研人员需在明确药用植物生理特性的基础上，综合考虑各环境因子的综合作用效果，选择运行成本低、效果好的调控手段进行优化控制。通过在较大空间内优化环境条件，以满足药用植物在不同生长阶段对特定生长条件的需求，达到最佳生长效果，缩短生长周期◥，提高生产效率。另一方面，利用植物工厂条件可控的优势，人为设计药用植物次生代谢调控措施，促进有效成分合成与积累，提高其药用价值。
通过不断研究试验，一系列高附加值和濒危的药用植物的生长习性已掌握，可利用“植物工厂”模拟野生】中草药的生长环境，并通过有效调控手段提高药用有效成分在植物体内的含量，增加经济效益。植物工厂种植药用植物才刚刚起⊙步，将会有越来越多有价值的药用植物入住植物工厂。
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