作为农业的“芯片”,种子是保障粮食安全和农产品有效供给的重要基础。今年的中央一号文件中就明确提出,要将抓好粮食生产和重要农产品供给摆在首要¤位置。但由于育种规模不断扩大,传统的育种方式逐渐无法满足市场的需求,而育种加速器作为未来大数据时代的育种新兴载体☆和科技手段也就此应运而生。
与传统育种相比,育种加速器具有检测速度更快、成本更低、通量更大等特点,能够更高效地对更多植株进行基因检测和反□ 馈。现代农业育种的一个主要方向就是性状改良,以获得更大◣的果实/种子,更高的含油量(油料作物),更发达的根系等,育种加速器可以快速获取大量植物表型信息,通过基因编辑完成种╳子的优胜劣汰。
育种加速器的定义
育种加速器主要由基因编辑、植物工厂系统集成和高通量植物表型平台三大功能构⌒ 成。通过高通量植物☆表型平台对植物生长的观测和▼性状分析,以基因组技术对植株进行▼基因编辑,形成分子层面的选择、回交育种、杂交〖种纯度检验等,打造出特定的基因芯片,并以植物工厂的㊣系统集成为载体,达到育种加速、更新迭代的目的,实现作物的周年○生产。
在育种加速器中ぷ,科研人员将大规模基因组测序和植物表型信息相结合,构建服务于育种的基因组技术工具——基因芯片。通过整合表型大数据与基因组大数据,科研人员能够发现基因组∩分子标记和田间表现的关联,再运用自动化的种◥子切片技术,在实验室即可在大量材☆料中筛选出最优品种从而形成迭代▆,大大减少田间的工作和花费。
通过︻对作物DNA的测∑序和分析,改造、定制标准化的基因芯片,形成基因大数据库,针对不同市场√、不同人群培育出满足(如节水抗旱、抗虫害、抗除草剂、耐碱、高肥效、高产等)不同特性的种●子,最终¤形成企业化、市场化的大规模制种。
基因编辑 主效QTL定位
采用极端单株池进行基因定位,根据要々定位的目标性状,分别提取等量组织(叶片)抽取DNA,用于芯片检测。
基因精细定位和克◥隆
根据基因初定位结果,筛选◥重组单株,对基因进行精细□定位。
功能基因鉴↘定
挑选代表性的单株进行基因芯▓片分析,通过基因区段←及基因功能标记,进行功能鉴定。
纯合度、指纹检测/遗传连锁图谱》构建
抽取№种子或叶片,混合抽提DNA作芯片←检测,对单个样品进▅行基因型分析,并对群体进行遗传连锁图谱构建。
优势预测/种质资源分类
抽取种子或〗叶片,混合抽提DNA作芯片检测,对种质进行基因型鉴定和聚类分析。
定向改良新品★种培育/定制
利用基因编辑进行品种定向改良和新品种培育,利用单基因■品系培育动态多系品种和特优品种。
1.基≡因定位精准
遗传背景标记和功能基因标记等多态性标记让基因精细定位更精准。
2.检测基因数目多检测位点数量♂大
数◥以万计的有效基因标记库源数据分析,保证基㊣ 因测序质量高、吻合度高,优化种质▂分类。
3.定制化改良和培育
专属定制化服务╲,利用基因编辑进行品种定向改良和新品种培育。
4.育种时间大幅缩短
通过基因编辑筛选培育的植株,可将育种时间从8~10年缩短至2~3年。